公司的历史可以追溯到1833年前(清道光年间)创办的永丰蜜店。
1956年,永丰蜜店与万和养蜂场、志诚养蜂场、维臣蜜蜡社等公私合营成立北京市蜜蜡加工厂,后更名为北京市蜂产品公司。
1999年,公司实行现代企业制度,进行了股份制改造。经过几次重大的历史变革,经过几代人的苦心经营,公司获得了长足的发展。
2004年7月,为了谋求更好的发展环境,公司将总部迁入了北京经济技术开发区,并在开发区建成了保健品生产车间。在房山长阳新建了蜂蜜生产加工基地,完成了生产基础设施和技术的升级。
2011年4月再次更名为北京百花蜂业科技发展股份公司。
2019年,在北京市供销社的集团化发展战略的指引下,为了满足不断扩大的市场需求,百花在廊坊经济开发区建设廊坊百花蜂产品有限公司,建成投产后年产蜂蜜将达2万吨。
2022年,按照北京市供销市社的安排,自然人股东退出股权,由北京供销社投资管理中心100%持股,公司更名为北京百花蜂业科技发展有限公司。
百花人把“做大自然的天使,为人类健康尽力”作为企业的使命,促进人类健康,为人类造福。